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深紋核桃全基因組破譯

  • 發(fā)布時間:2016-02-03 01:29:59  來源:科技日報  作者:佚名  責(zé)任編輯:羅伯特

  ■最新發(fā)現(xiàn)與創(chuàng)新

  科技日報云南楚雄2月2日電 (記者馬波)中科院昆明植物研究所研究員、中國西南野生生物種質(zhì)資源庫副主任李唯奇博士2日在云南楚雄摩爾農(nóng)莊生物科技開發(fā)公司向媒體發(fā)布:由他帶領(lǐng)的聯(lián)合研究團隊,與廣州基迪奧生物科技公司合作,完成了我國首個深紋核桃全基因組測序,繪制出核桃基因組圖譜,這也是世界上首例胡桃科植物基因組圖譜。標志著我國核桃產(chǎn)業(yè)基礎(chǔ)研究進入分子生物學(xué)時代,為大力發(fā)展木本油料和云南低緯度高原特色產(chǎn)業(yè)奠定了堅實的科學(xué)基礎(chǔ)。

  我國現(xiàn)有核桃屬植物8種,云南的深紋核桃,也叫云南核桃,是我國西南特有的物種。研究團隊從云南無量山國家級自然保護區(qū)的原始森林中,采集了深紋核桃野生祖先種的葉片,利用二代測序Solexa和三代測序PacBio結(jié)合的測序技術(shù),完成了核桃的高質(zhì)量全基因組測序以及精細圖譜組裝。初步分析發(fā)現(xiàn),核桃在其進化歷史中,分別在5700萬年前和1200萬年前發(fā)生過兩次大規(guī)模全基因組復(fù)制事件,并預(yù)測了4215個抗性相關(guān)的基因。深紋核桃基因組精細圖譜填補了胡桃科基因組測序的空白,將對該科植物研究提供最重要的基礎(chǔ)支撐。

  核桃基因組的研究成果,將會引領(lǐng)核桃產(chǎn)業(yè)鏈上各關(guān)鍵環(huán)節(jié)的科技創(chuàng)新。后續(xù)通過比較不同核桃品種的基因組信息,可以發(fā)現(xiàn)控制核桃殼厚薄、早產(chǎn)豐產(chǎn)、樹形高矮、抗逆等重要性狀的遺傳密碼,從而為核桃優(yōu)良品種選育、保護和推廣提供強有力的工具;通過探明核桃營養(yǎng)保健功能的遺傳基礎(chǔ),為核桃仁產(chǎn)品的精深開發(fā)和核桃營養(yǎng)學(xué)提供方法、指明方向;通過比較核桃的野生祖先種和栽培種的基因組信息,還可以探索我國各族人民開發(fā)利用核桃自然資源的文明歷史。

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