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中國院企聯(lián)合啟動(dòng)“云之稻”項(xiàng)目平臺(tái) 加速“水稻設(shè)計(jì)育種”

  • 發(fā)布時(shí)間:2015-09-15 20:00:00  來源:中國新聞網(wǎng)  作者:佚名  責(zé)任編輯:羅伯特

  中新社長沙9月15日電 (記者 劉柱)中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院、阿里云計(jì)算有限公司、華智水稻生物技術(shù)有限公司、北京聚道科技有限公司15日在長沙共同宣布啟動(dòng)“云之稻”項(xiàng)目平臺(tái)——3000份綠色超級(jí)稻基因組原始測序數(shù)據(jù)(下稱“3000份水稻基因組”)。

  上述合作者稱,根據(jù)協(xié)議,“云之稻”項(xiàng)目平臺(tái)將無償向全球共享數(shù)據(jù),并將逐步建立最全面的“水稻功能基因組和育種信息數(shù)據(jù)庫”,其研究將加快規(guī)模化發(fā)掘水稻優(yōu)良基因,突破水稻復(fù)雜性狀分子改良的技術(shù)瓶頸,加快高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)、廣適性新品種培育進(jìn)程,全面提升中國及全球水稻基因組研究和分子育種水平。

  “3000份水稻基因組”是源于國家科技部和比爾·梅琳達(dá)蓋茨基金會(huì)資助的“為非洲和亞洲資源貧瘠地區(qū)培育綠色超級(jí)稻”重大科技專項(xiàng)(簡稱“綠色超級(jí)稻”)重要課題成果,是迄今為止全世界最大的植物基因組測序項(xiàng)目。

  “3000份水稻基因組”代表了25萬種子中95%的多樣性,其重要性在于分析得到的數(shù)據(jù)將為水稻的基礎(chǔ)認(rèn)識(shí)和育種提供基礎(chǔ)信息資源。

  華智水稻生物技術(shù)有限公司信息總監(jiān)王冰冰透露,目前,“3000份水稻基因組”分析得到的數(shù)據(jù)量達(dá)到幾百TB(萬億字節(jié)),如按常規(guī)方式處理如此大規(guī)模的數(shù)據(jù),單個(gè)研究團(tuán)隊(duì)、科研機(jī)構(gòu)均會(huì)遇到下載難、存儲(chǔ)難、分析難、運(yùn)算難等問題,費(fèi)時(shí)費(fèi)力且成本高。

  阿里云高級(jí)專家林河山介紹,“云之稻”項(xiàng)目平臺(tái)是構(gòu)建在阿里云的對(duì)象存儲(chǔ)服務(wù)和批量計(jì)算服務(wù)之上,在解決上述難題的同時(shí),“‘云之稻’項(xiàng)目平臺(tái)上的云端基因組數(shù)據(jù)還可以隨時(shí)為全球科學(xué)家所用”。

  “‘云之稻’項(xiàng)目平臺(tái)是公益性的,不僅讓研究者免費(fèi)下載訪問水稻基因組數(shù)據(jù),還提供常用分析工具和數(shù)據(jù)。”王冰冰說,通過使用這些工具可以免費(fèi)調(diào)用阿里云的計(jì)算資源,從而方便快捷地對(duì)基因大數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。

  綠色超級(jí)稻項(xiàng)目首席科學(xué)家、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所黎志康博士表示,“3000份水稻基因組”的測序需要全世界所有科學(xué)家和有興趣的人士通過“云之稻”項(xiàng)目平臺(tái)參與數(shù)據(jù)分析和共享,為加速未來的“水稻設(shè)計(jì)育種”提供基礎(chǔ)信息資源,“‘云之稻’項(xiàng)目還將結(jié)合功能基因組學(xué)新的方法和策略進(jìn)行生物育種,將貢獻(xiàn)于糧食安全、食品健康的發(fā)展”。(完)

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