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大黃魚全基因組精細(xì)圖譜繪制完成

  • 發(fā)布時間：2015-05-04 03:35:50  來源：科技日報  作者：佚名  責(zé)任編輯：羅伯特

　　■動態(tài)播報

　　科技日報訊 （李來）4月2日，國家海洋局第三海洋研究所、浙江大學(xué)、深圳華大基因研究院、青島海洋大學(xué)和深圳大學(xué)聯(lián)合完成了大黃魚全基因組測序，并繪制出大黃魚基因組精細(xì)圖譜。研究揭示了大黃魚對環(huán)境脅迫應(yīng)答的分子機(jī)制，為抗逆性的遺傳改良提供了重要資源。該成果在線發(fā)表于國際著名學(xué)術(shù)期刊《美國公共科學(xué)圖書館——遺傳學(xué)》。

　　大黃魚是中國和東亞國家最具經(jīng)濟(jì)價值的海洋魚類之一。其具有特殊的行為和生理特性，對于低氧和空氣暴露等環(huán)境脅迫極為敏感。這些特性使大黃魚成為研究環(huán)境脅迫應(yīng)答機(jī)制的良好模型。為了探索大黃魚對環(huán)境脅迫應(yīng)答的分子和遺傳機(jī)制，研究人員采用BAC組裝策略與全基因組鳥槍法相結(jié)合的方法，克服了大黃魚基因組的高雜合特性，對大黃魚全基因組進(jìn)行了測序，并獲得了大黃魚基因組精細(xì)圖譜。組裝的大黃魚基因組大小為679 Mb，包含25401個蛋白編碼基因。

　　此外，研究人員還對大黃魚進(jìn)行了腦部低氧轉(zhuǎn)錄組和皮膚粘液蛋白質(zhì)組的研究。研究揭示了神經(jīng)—內(nèi)分泌—免疫/代謝新的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)在大黃魚腦應(yīng)答低氧脅迫中起到了關(guān)鍵的作用。他們還發(fā)現(xiàn)暴露在空氣中的皮膚黏液含有3209種基因編碼的蛋白，這是目前在魚類黏液研究中發(fā)現(xiàn)最多的，這些蛋白的主要功能抗氧化、氧氣運(yùn)輸?shù)龋沂玖似つw黏液蛋白在大黃魚應(yīng)對空氣暴露脅迫中的多重保護(hù)功能。

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