我國(guó)率先完成寨卡病毒全基因組序列測(cè)定
- 發(fā)布時(shí)間:2016-02-26 08:58:31 來(lái)源:人民日?qǐng)?bào)海外版 責(zé)任編輯:吳起龍
春節(jié)期間,我國(guó)廣東省出現(xiàn)寨卡病毒輸入性感染病例后,軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院微生物流行病研究所迅即啟動(dòng)應(yīng)急工作機(jī)制,與廣州市第八人民醫(yī)院、出入境檢驗(yàn)檢疫系統(tǒng)相關(guān)單位密切合作,在獲得從委內(nèi)瑞拉歸國(guó)患者臨床標(biāo)本后,采用高通量測(cè)序技術(shù),于2月21日直接從尿液中獲得病毒全基因組序列。
據(jù)專(zhuān)家介紹,這是我國(guó)首次獲得寨卡病毒全基因組序列,也是全球首次直接從患者尿液中獲得病毒全基因組。該病毒基因組全長(zhǎng)10.8kb,系統(tǒng)進(jìn)化分析表明,屬于亞洲世系,與巴西、蘇里南、波多黎各等美洲國(guó)家流行毒株同源性為99.7%;核苷酸序列比對(duì)發(fā)現(xiàn)20個(gè)突變位點(diǎn),其中5個(gè)突變位點(diǎn)導(dǎo)致氨基酸改變。
專(zhuān)家指出,寨卡病毒全基因組序列的獲得,為病毒的溯源和進(jìn)化提供了重要證據(jù),可用于指導(dǎo)診斷試劑、疫苗和藥物的研發(fā),使我國(guó)在全球寨卡疫情防控中占得先機(jī)。同時(shí),直接從患者尿液獲取病毒全基因組序列,解決了復(fù)雜臨床樣品中病原體高通量測(cè)序的技術(shù)難題,為臨床診療方案和出院標(biāo)準(zhǔn)的優(yōu)化提供了科學(xué)依據(jù)。
寨卡病毒屬于黃病毒屬黃病毒科,是一種主要由伊蚊傳播的蟲(chóng)媒病毒。1947年首次在烏干達(dá)寨卡叢林中的恒河猴體內(nèi)分離出該病毒,全長(zhǎng)基因組序列在2007年被測(cè)出。雖然目前還沒(méi)有輸血傳播病例發(fā)生,但已經(jīng)在個(gè)別供血者血樣中檢測(cè)到寨卡病毒,他們是無(wú)癥狀的寨卡病毒感染者。感染寨卡病毒的人群中通常僅有20%的人發(fā)病,潛伏期為3至12天。寨卡病毒流行的地理分布、臨床表現(xiàn)與登革熱、基孔肯雅熱十分相近,且均為蚊蟲(chóng)叮咬傳播,因此很容易造成誤診。
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