我國(guó)農(nóng)村污水處理設(shè)施建設(shè)主要依靠地方資金來源，中央在農(nóng)村環(huán)境治理的資金投入主要在于引導(dǎo)地方資金。為了引導(dǎo)資金投入到農(nóng)村環(huán)境治理，規(guī)定中央財(cái)政資金需要有地方配套資金。目前，中央、地方省級(jí)、地方村級(jí)、地方農(nóng)業(yè)土地住建等其他部門投資共同組成農(nóng)村環(huán)境治理投資資金。

　　推進(jìn)方式也在不斷出新。2008年-2009年，農(nóng)村環(huán)境治理運(yùn)營(yíng)方式主要是“以獎(jiǎng)促治”，即農(nóng)村開展整治并達(dá)到效果后，中央會(huì)以資金進(jìn)行獎(jiǎng)勵(lì)。

　　近年來，國(guó)家新增的“連片整治”運(yùn)營(yíng)方式逐步成為主流。從2010年開始，財(cái)政部、環(huán)保部等部門聯(lián)合開展農(nóng)村環(huán)境“連片整治”專項(xiàng)工作；2010-2013年，國(guó)家以“連片整治”為主，重點(diǎn)解決突出環(huán)境問題，并逐步摸索經(jīng)驗(yàn)。從總結(jié)評(píng)估結(jié)果來看，試點(diǎn)省份基本達(dá)到預(yù)期效果。

　　同時(shí)，國(guó)家支持“連片整治”執(zhí)行效果好、且具備相應(yīng)財(cái)政實(shí)力的省份開展“拉網(wǎng)式全覆蓋”運(yùn)營(yíng)方式。2013年，國(guó)家選擇寧夏、江蘇兩省進(jìn)行“拉網(wǎng)式全覆蓋”試點(diǎn)工作，中央給予江蘇4.5億元、寧夏3.5億元撥款。

　　社會(huì)參與型的第三方委托運(yùn)營(yíng)模式將在未來的“整體捆綁+BOT模式”項(xiàng)目類型中將獲得發(fā)展。目前農(nóng)村污水處理運(yùn)營(yíng)模式主要分為政府主導(dǎo)型和社會(huì)參與型兩種，由于監(jiān)管成本、治理能力、技術(shù)水平等制約因素，政府主導(dǎo)型運(yùn)營(yíng)模式在未來將逐年下降，而社會(huì)參與型運(yùn)營(yíng)模式在國(guó)家“連片整治”以及“拉網(wǎng)式全覆蓋”等推進(jìn)方式背景下，能夠最大程度保證治理效果。

　　目前我國(guó)主要有“以獎(jiǎng)促治”、“連片整治”以及“拉網(wǎng)式全覆蓋”3條農(nóng)村環(huán)境治理的資金投入渠道。

　　“以獎(jiǎng)促治”方面，截至2013年，中央投入專項(xiàng)資金135億元；“連片整治”方面，目前中央財(cái)政直接投入近170億元，帶動(dòng)地方財(cái)政投入超過160億元；“拉網(wǎng)式全覆蓋”方面，寧夏、江蘇、重慶3省份共獲中央及省級(jí)資金60億元左右。面對(duì)龐大市場(chǎng)需求，我國(guó)農(nóng)村污水處理設(shè)施建設(shè)資金投入不足。

　　同時(shí)，運(yùn)營(yíng)權(quán)責(zé)主體模糊、運(yùn)營(yíng)監(jiān)管不足、財(cái)政壓力較大。在發(fā)達(dá)國(guó)家，政府、市場(chǎng)、個(gè)人在農(nóng)村污水處理均承擔(dān)相應(yīng)責(zé)任；對(duì)個(gè)人用戶而言，除承擔(dān)小部分建設(shè)成本外，普遍要求承擔(dān)運(yùn)營(yíng)費(fèi)用。

　　我國(guó)農(nóng)村污水處理管理及責(zé)任主體均較模糊。國(guó)家沒有明確農(nóng)村污水處理工作的管理及責(zé)任主體；地方管理體制差異很大，管理主體不明確，部門職責(zé)不清晰，造成開展農(nóng)村污水處理的協(xié)調(diào)難度大，并容易造成各部門依托不同的項(xiàng)目和投資渠道，一哄而上重復(fù)建設(shè)造成浪費(fèi)。

　　同時(shí)，農(nóng)村污水處理日常運(yùn)行和管理人員的知識(shí)及經(jīng)驗(yàn)欠缺，無法保障設(shè)施的科學(xué)運(yùn)行；尤其在凈化槽、MBR等先進(jìn)農(nóng)村污水處理技術(shù)上，雖然處理效果較好，但對(duì)技術(shù)人員要求較高，我國(guó)農(nóng)村的經(jīng)濟(jì)及科技水平難以適應(yīng)。

　　就一般情況來看，農(nóng)村污水處理設(shè)施建設(shè)資金由中央和地方共同投資，而項(xiàng)目建成后的運(yùn)營(yíng)資金主要由地方承擔(dān)（縣級(jí)+鄉(xiāng)村級(jí)）。以農(nóng)村居民人均生活污水量70升/人天、2012年農(nóng)村人口數(shù)量64222萬人數(shù)據(jù)基礎(chǔ)為例，假設(shè)農(nóng)村人口數(shù)量以2%速度遞減，則2014年全國(guó)農(nóng)村生活污水排放量約為4318萬噸/天；以農(nóng)村污水處理運(yùn)營(yíng)費(fèi)用1元/噸計(jì)算，則2014年的管理維護(hù)成本可達(dá)158億元；該項(xiàng)管理維護(hù)費(fèi)用一般由縣級(jí)和鄉(xiāng)鎮(zhèn)級(jí)政府承擔(dān)（縣級(jí)和鄉(xiāng)鎮(zhèn)級(jí)的承擔(dān)比例普遍為1:1），這將對(duì)地方政府造成較大財(cái)政壓力，從而影響其推動(dòng)農(nóng)村污水治理的積極性。

　　此外，我國(guó)尚不存在農(nóng)村污水處理統(tǒng)一的國(guó)家技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)，僅有《農(nóng)村生活污染控制技術(shù)規(guī)范》行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)；并且由于《城鎮(zhèn)污水處理廠污染物排放標(biāo)準(zhǔn)》、《污水綜合排放標(biāo)準(zhǔn)》等排放標(biāo)準(zhǔn)要求過高，考慮農(nóng)村與城市在經(jīng)濟(jì)以及技術(shù)水平存在較大差距，大部分地區(qū)達(dá)不到城鎮(zhèn)污水排放標(biāo)準(zhǔn)，否則將成為一項(xiàng)沉重的經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)，因此亟待制定適合農(nóng)村的生活污水排放標(biāo)準(zhǔn)。

　　我國(guó)農(nóng)村人口多、行政單元數(shù)量大，由于其經(jīng)濟(jì)發(fā)展水平、供水排水條件、生活風(fēng)俗習(xí)慣等方面的差異，導(dǎo)致不同地區(qū)農(nóng)村生活污水污染狀況不同。因此，農(nóng)村生活污水排放標(biāo)準(zhǔn)的制定必須根據(jù)當(dāng)?shù)剞r(nóng)村經(jīng)濟(jì)發(fā)展水平、污染物排放特征、環(huán)境影響評(píng)價(jià)、污染對(duì)象測(cè)算等因素，科學(xué)確定污染控制指標(biāo)和排放限值，合理制定相關(guān)技術(shù)參數(shù)及測(cè)試指標(biāo)的適宜性，不能照搬國(guó)外農(nóng)村污水排放標(biāo)準(zhǔn)。