便攜式基因組測序裝置可助實時監(jiān)控疫情
- 發(fā)布時間:2016-02-04 13:07:00 來源:新華社 責任編輯:羅伯特
新華社倫敦2月3日電(記者張家偉)一個國際團隊3日在英國《自然》雜志上報告說,去年埃博拉疫情肆虐期間,一種便攜式基因組測序裝置能方便地部署在條件簡陋的疫區(qū),幫助監(jiān)控疫情,未來可用這種裝置應對其他疫情。
在監(jiān)控疫情方面,病毒基因組測序獲取的信息有助于了解病毒在大規(guī)模傳播過程中出現(xiàn)了何種變異,這對判斷疫情發(fā)展趨勢非常重要。但由于病毒傳播速度快,如何更快更高效地完成相關分析流程就成為關鍵。
英國、德國和加拿大等國研究人員組成的科研團隊設計了一個輕便的疫情監(jiān)控系統(tǒng),它能裝進符合航空公司運輸標準的行李箱中運輸。這個系統(tǒng)的核心組成部分是一種名為MinION的小型測序儀,其重量小于100克,可以通過電腦的USB接口來充電。
在去年埃博拉肆虐期間,這個系統(tǒng)曾被率先部署在西非國家?guī)變?nèi)亞的一個疫區(qū)。研究人員在埃博拉患者身上收集到樣本后,在現(xiàn)場利用這個系統(tǒng)進行病毒基因組測序,無需再把這些樣本長途運回實驗室。
據(jù)研究人員介紹,他們利用這一系統(tǒng)在當?shù)貙?42份埃博拉病毒樣本進行了測序分析,取得了非常不錯的效果。通常在獲得樣本后的24小時內(nèi)就可以完成整個分析流程,研究人員能及時獲得疫情發(fā)展的最新信息。
報告作者之一、伯明翰大學學者尼克·洛曼說,基因組測序反映的信息在疫情暴發(fā)期間對研究人員來說非常重要,以往這項繁瑣工作只能在配備大型設備的實驗室里才能完成,而便攜式測序裝置有望改變這種狀況。
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