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科學(xué)家揭示線粒體變身“甜甜圈”規(guī)律
- 發(fā)布時(shí)間:2015-09-25 03:33:09 來(lái)源:科技日?qǐng)?bào) 責(zé)任編輯:羅伯特
科技日?qǐng)?bào)訊 (黃博純)Cell出版社生物物理學(xué)權(quán)威雜志《生物物理雜志》(Biophysical Journal)日前在線發(fā)表了中科院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院劉興國(guó)研究組的研究成果。該研究針對(duì)缺氧/復(fù)氧病理?xiàng)l件下線粒體應(yīng)答的新形態(tài)-“甜甜圈(donut)”,首次通過(guò)構(gòu)建3D動(dòng)態(tài)數(shù)學(xué)模型計(jì)算結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)換中的自由能變化,論證了線粒體“甜甜圈”形成的自發(fā)性和“甜甜圈”存在的穩(wěn)定性。
缺氧/復(fù)氧過(guò)程廣泛存在于心腦血管、腎病等多種疾病以及人工手術(shù)過(guò)程中,比如心臟缺血再灌注,在這個(gè)過(guò)程中,在缺血時(shí)組織細(xì)胞面臨缺氧和葡萄糖缺乏導(dǎo)致的饑餓,恢復(fù)供血后細(xì)胞突然大量死亡,造成器官壞死和功能異常。研究組以此病理學(xué)為基礎(chǔ),在前期研究中發(fā)現(xiàn)線粒體應(yīng)答的新形態(tài)-“甜甜圈”,這一“甜甜圈”形態(tài)的線粒體在環(huán)境條件恢復(fù)正常時(shí)可以迅速恢復(fù)膜電勢(shì),恢復(fù)正常呼吸功能。然而,缺氧/復(fù)氧病理?xiàng)l件下線粒體由正常的線狀或粒狀變?yōu)椤疤鹛鹑Α钡牧W(xué)機(jī)制和能量過(guò)程一直不清楚。
該研究精確測(cè)量了線粒體的直徑,并統(tǒng)計(jì)線粒體“甜甜圈”環(huán)結(jié)構(gòu)直徑的數(shù)值分布(95%大于0.8微米)。在此基礎(chǔ)上,該研究構(gòu)建了3D光滑曲面的“幾何線粒體”模型,通過(guò)對(duì)曲面任意點(diǎn)的積分定量線粒體的3D空間信息,因此這一模型可以模擬線粒體的實(shí)時(shí)動(dòng)力學(xué):膨脹/縮小,融合/分裂,彎曲和變身為有尾巴和無(wú)尾巴的兩種“甜甜圈”。研究組通過(guò)計(jì)算線粒體從線狀變身為“甜甜圈”的過(guò)程中彎曲能和滲透壓能的變化,構(gòu)建了這一過(guò)程自由能變化模型。結(jié)果表明,彎曲能是線粒體變身為“甜甜圈”的主要障礙,而“甜甜圈”直徑小于0.8微米將帶來(lái)極大的自由能增加。這一模擬計(jì)算的結(jié)論與實(shí)際觀察的“甜甜圈”環(huán)結(jié)構(gòu)直徑的數(shù)值分布完全一致。
細(xì)胞能量狀態(tài)和亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)換一直是外界信號(hào)調(diào)控的兩大方面。本研究建立了3D動(dòng)態(tài)數(shù)學(xué)模型,論證了線粒體結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)換中的能量控制機(jī)制,是細(xì)胞能量狀態(tài)和亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)換之間相互作用的范例。線粒體處于不斷的動(dòng)態(tài)中,這對(duì)于細(xì)胞的“生老病死”非常重要。該研究針對(duì)缺氧/復(fù)氧這一重要病理?xiàng)l件下,線粒體應(yīng)答外界壓力變身為新形態(tài)“甜甜圈”,闡明了這一過(guò)程發(fā)生的自發(fā)性和“甜甜圈”存在的穩(wěn)定性,是線粒體適應(yīng)性動(dòng)力學(xué)應(yīng)答的新模式。
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