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首個(gè)“現(xiàn)代蛙類”基因組破譯

  • 發(fā)布時(shí)間：2015-03-18 01:29:59  來(lái)源：科技日?qǐng)?bào)  作者：佚名  責(zé)任編輯：羅伯特

　　科技日?qǐng)?bào)訊 （記者馬波）中科院昆明動(dòng)物研究所張亞平院士以及車(chē)靜研究員課題組與華大基因國(guó)家基因庫(kù)及德克薩斯大學(xué)奧斯汀分校等單位合作，成功破譯了首個(gè)“現(xiàn)代蛙類”——高山倭蛙的基因組。

　　研究人員估算高山倭蛙和熱帶爪蟾的分歧時(shí)間大概在266百萬(wàn)年前。盡管兩者分歧時(shí)間很久，但是兩物種染色體間的重排特別少，說(shuō)明蛙類基因組可能具有相對(duì)較慢的進(jìn)化速率。這一猜想在染色體內(nèi)部重排速率、基因區(qū)及全基因組的替換速率等多個(gè)層面都得到證實(shí)，即兩棲動(dòng)物，甚至整個(gè)冷血?jiǎng)游?，具有比恒溫?dòng)物更低的進(jìn)化速率。

　　高山倭蛙基因組的破譯，使我們進(jìn)一步確認(rèn)了更多的人類、鳥(niǎo)類、蛙類基因組中的染色體斷裂和融合區(qū)域，同時(shí)也鑒定了兩棲動(dòng)物中高度保守的區(qū)域，為后續(xù)的兩棲動(dòng)物比較基因組學(xué)提供了良好的研究基礎(chǔ)。盡管四足動(dòng)物有3.6億年的進(jìn)化史，在人的染色體中仍可以看到較長(zhǎng)的祖先序列被完整保留下來(lái)。通過(guò)分析染色體斷裂，融合事件，發(fā)現(xiàn)人的染色體間重排最劇烈，雞和兩棲動(dòng)物染色體間重排相對(duì)較少。最后，該研究還發(fā)現(xiàn)了高山倭蛙特有的三類抗菌肽（AP01357，AP00097，和AP01583），其中AP01583已被證實(shí)在氧化應(yīng)激和應(yīng)對(duì)病原微生物方面具有重要作用，這些特有抗菌肽的存在可能在高山倭蛙適應(yīng)高海拔環(huán)境中起一定保護(hù)作用。

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