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我科學(xué)家繪制全球首個(gè)青稞基因組圖譜
- 發(fā)布時(shí)間:2015-01-26 01:30:51 來源:科技日?qǐng)?bào) 責(zé)任編輯:羅伯特
科技日?qǐng)?bào)訊 (記者劉傳書)青稞經(jīng)過藏族人民長(zhǎng)達(dá)3500—4000年的馴化栽培,已經(jīng)完全適應(yīng)了極端的高原氣候,成為了藏族人民的主食。全球首個(gè)青稞基因組圖譜由我國(guó)科學(xué)家正式繪制成功,1月13日,其研究成果在線發(fā)表在PNAS雜志上。研究成果揭示了青稞的高原適應(yīng)性機(jī)制,解讀其起源、馴化及栽培選育過程。
科學(xué)家對(duì)西藏的地方品種青稞進(jìn)行了全方位解讀。據(jù)估計(jì),青稞基因組大小約為4.5Gb,本次研究所構(gòu)建的青稞基因組圖譜大小為3.89Gb,共占青稞基因組的87%。研究人員將青稞基因組和其他的禾本科作物基因組進(jìn)行了比對(duì),發(fā)現(xiàn)青稞約于1700萬年前從粗山羊草,烏拉爾圖小麥以及冬小麥中分離出來。現(xiàn)代青稞基因組中仍然有大量的序列同粗山羊草,烏拉爾圖小麥和短柄二葉草相似,其相似基因家庭數(shù)目高達(dá)18849個(gè)。
進(jìn)一步對(duì)青稞的高原適應(yīng)性和人工選擇情況研究發(fā)現(xiàn),一系列在青稞品種中發(fā)生了正向選擇的基因家族。如,調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄過程的基因家族,激活轉(zhuǎn)錄因子的基因家庭,防御反應(yīng)相關(guān)的基因家庭等都得到了大量的擴(kuò)張,這些基因家族的擴(kuò)張使得青稞在面對(duì)高原的惡劣環(huán)境時(shí)具有更大的調(diào)節(jié)彈性,從而具有更好的適應(yīng)性。此外,一些調(diào)節(jié)信號(hào)通路的關(guān)鍵基因,如參與植物荷爾蒙信號(hào)傳導(dǎo),基因復(fù)制和修復(fù),植物病菌反應(yīng)等,都在青稞中表現(xiàn)出了正向選擇。這些基因改變使得青稞具有更好的高原適應(yīng)性和壓力調(diào)節(jié)機(jī)制。這些結(jié)果的發(fā)現(xiàn)對(duì)于解讀高原作物的適應(yīng)性機(jī)制意義重大,給未來青稞作物以及其他高原作物的培育提供了重要的參考資料,將有助于解決青藏高原以及其他高原地區(qū)人民的糧食問題,改善他們的生活條件。
西藏農(nóng)牧科學(xué)院、西藏大麥和牦牛培育重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、中科院、華大基因等單位研究人員參加了此項(xiàng)目研究。
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