全基因組選擇，是近年來畜禽分子育種的全新策略，已成為動、植物分子輔助育種的熱點和趨勢。它突破了對候選個體從表型選擇到基因組選擇，解決了畜禽肉質(zhì)和抗性等難以選育性狀的障礙，提高了遺傳評定的準確性，實現(xiàn)了低成本早期選擇。

　　在國家863計劃課題“基于高密度SNP芯片的牛、豬基因組選擇技術(shù)研究”支持下，中國農(nóng)業(yè)大學聯(lián)合海南大學、華中農(nóng)業(yè)大學、浙江大學以及廣東溫氏新興育種公司和北京奶牛中心等單位合作攻關，以杜洛克種豬和荷斯坦奶牛為研究對象，采用全基因組SNP芯片對豬、?；蚪M育種值估計，更準確地對種用家畜進行早期選種，這成為我國首次開展的家畜全基因組選擇技術(shù)研究及應用。

　　該技術(shù)基于畜禽全基因組高密度單核苷酸多態(tài)性(SNP)芯片技術(shù)平臺，獲得覆蓋全基因組的標記信息，通過與對應的重要經(jīng)濟性狀的表型信息進行全基因組關聯(lián)分析，估計出基因組中每個標記的效應，最后利用估計的標記效應估算出個體的育種值（gEBV）。

　　研究人員結(jié)合我國種豬和奶牛育種實踐，構(gòu)建了杜洛克公豬和中國荷斯坦奶牛基因組選擇的參考群體，創(chuàng)建了基因組選擇的核心技術(shù)體系和實施條件；依據(jù)研究性狀成功建立了群體表型數(shù)據(jù)庫，以及更準確、有效的全基因組選擇新方法，提高了gEBV估計準確性，擴大了gEBV估計的適用范圍；基于核基因組和線粒體基因組遺傳變異特性，構(gòu)建了家豬種質(zhì)特性分子鑒定平臺；全面、系統(tǒng)地分析了具有不同種質(zhì)特征豬品種的遺傳變異，實現(xiàn)了種質(zhì)基因資源的高效發(fā)掘及分子標記的開發(fā)。

　　日前，在廣東溫氏食品集團有限公司新興育種公司種豬場，已開展了杜洛克種公豬的選種并用于后續(xù)的種豬生產(chǎn)。項目中所建立的奶?；蚪M選擇技術(shù)已用于我國荷斯坦公牛的遺傳評估，并成為農(nóng)業(yè)部奶牛良種補貼計劃中青年公牛的選擇依據(jù)。該課題已發(fā)表SCI論文15篇，獲得國家授權(quán)發(fā)明專利5項，國家軟件著作權(quán)證書6項。