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長牡蠣和櫛孔扇貝全基因組框架圖繪制完成
- 發(fā)布時(shí)間:2014-11-24 01:30:52 來源:科技日?qǐng)?bào) 責(zé)任編輯:羅伯特
本報(bào)記者 馬愛平
■聚焦農(nóng)業(yè)863
日前,,并篩查得到與重要性狀相關(guān)的基因或信號(hào)通路,在國際上填補(bǔ)了冠輪動(dòng)物基因組學(xué)研究空白。
這是在國家863計(jì)劃支持下,由中國海洋大學(xué)、中國科學(xué)院海洋研究所、中國水產(chǎn)科學(xué)研究院黃海水產(chǎn)研究所、中國科學(xué)院南海海洋研究所、威海長青海洋科技股份有限公司、大連獐子島漁業(yè)集團(tuán)股份有限公司完成的“基于全基因組信息的貝類遺傳選育”課題的重要成果。
長牡蠣基因組圖譜發(fā)表于生物學(xué)權(quán)威期刊《Nature》上。課題組在全基因組規(guī)模系統(tǒng)篩查了動(dòng)物基因組中常見的一種分子標(biāo)記——單核苷酸多態(tài)性,對(duì)重要基因多態(tài)性進(jìn)行了深入研究。
該課題組還研發(fā)了一種新型高通量、低成本的全基因組基因分型技術(shù)——2bRAD,突破了依賴已知基因組信息和昂貴芯片技術(shù)的瓶頸,為非模式生物全基因組范圍內(nèi)解析遺傳變異與性狀關(guān)系提供了核心技術(shù)手段,開發(fā)了無參照基因組的精準(zhǔn)分型新算法和軟件,與國際日前主流算法相比,準(zhǔn)確率提高20%以上。
這些技術(shù)方法突破使大規(guī)模開發(fā)水生生物分子標(biāo)記、開展全基因組選擇育種成為可能,標(biāo)志著我國的分子育種方法學(xué)研究已躍居國際前沿。
課題組完成了櫛孔扇貝和長牡蠣的高密度遺傳圖譜構(gòu)建,精細(xì)定位了經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)的重要候選基因。其中,櫛孔扇貝圖譜標(biāo)為目前已知水產(chǎn)生物上精度最高的圖譜。建立了國際上首個(gè)貝類全基因組選擇育種分析評(píng)估系統(tǒng),研發(fā)了全基因組基因型效應(yīng)評(píng)估算法,提高了貝類全基因組選育的效率和水平。
該課題組成功培育了兩個(gè)國家審定的貝類新品種。其中,“蓬萊紅2號(hào)”兩齡貝較普通生產(chǎn)用種增產(chǎn)53.5%,是國內(nèi)外第一個(gè)采用全基因組選擇育種技術(shù)育成的良種,在山東推廣創(chuàng)收達(dá)4700余萬元;“海大1號(hào)”15月齡平均殼高較普通商品苗種養(yǎng)殖提高16.2%,總濕重提高24.6%,出肉率提高18.7%,在山東、遼寧等地中試,平均畝增產(chǎn)24.6%,課題執(zhí)行期內(nèi)新增產(chǎn)值1700多萬元。
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