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虛擬篩選加快藥物研發(fā)速度

  • 發(fā)布時間：2014-10-14 01:30:42  來源：科技日報  作者：佚名  責任編輯：羅伯特

　　■生活風向標

　　科技日報訊 （記者劉園園）由北京市計算中心開發(fā)的“計算機輔助藥物篩選平臺”，近日正式開放。該平臺運用虛擬藥物篩選技術(shù)，提供蛋白質(zhì)靶向小分子化合物的篩選和優(yōu)化服務(wù)，有望使該類藥物的早期研發(fā)時間縮短一半。

　　“這是我國第一家商業(yè)化的虛擬藥物篩選平臺，可以通過互聯(lián)網(wǎng)向國內(nèi)外藥物研發(fā)科研院所和企業(yè)提供遠程服務(wù)?！敝鞒制脚_研發(fā)的北京市“海聚工程”人才趙勇博士告訴科技日報記者。

　　趙勇介紹，小分子化合物類藥物是現(xiàn)代藥物大家庭中占比最大的一類。通過和人體內(nèi)導致疾病的蛋白質(zhì)發(fā)生作用來發(fā)揮療效?！暗鞍踪|(zhì)的三維結(jié)構(gòu)就像一套房子一樣有不同的‘房間’，如果導致疾病的‘房間’被小分子化合物堵住，它的功能就停止，疾病就得到治療”。

　　“利用這一特性，我們可以在計算機中建立小分子化合物和蛋白質(zhì)的三維模型，并利用相關(guān)軟件進行二者的模擬對接，最終篩選出可能調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)功能的小分子化合物?！壁w勇說，這樣就可以把藥物篩選工作交給計算機來做。

　　趙勇告訴記者，“計算機輔助藥物篩選平臺”依托運算能力達每秒200萬億次的超算集群，10萬個小分子化合物和一種蛋白質(zhì)上某個“房間”的對接工作最快1個小時便可完成，費用也只有5000元左右?！皞鹘y(tǒng)實驗篩選的命中率只有十萬分之一到萬分之一，虛擬藥物篩選的命中率在2%在40%之間，是實驗篩選命中率200倍以上”。

　　趙勇說，早期藥物研發(fā)一般需要三到五年時間，借助虛擬篩選平臺有望縮短到兩年以內(nèi)。

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