我國率先構(gòu)建野生大豆泛基因組
- 發(fā)布時間:2014-09-16 07:51:49 來源:科技日報 責(zé)任編輯:羅伯特
■最新發(fā)現(xiàn)與創(chuàng)新
科技日報訊 (記者瞿劍)中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所與諾禾致源等合作,在國際上率先構(gòu)建和分析了一年生野生大豆的泛基因組,為作物種質(zhì)資源研究和利用提供了新的方法和啟示。該研究成果9月14日在線發(fā)表于國際著名學(xué)術(shù)期刊《自然—生物技術(shù)》。
項目牽頭人、中國農(nóng)科院作科所研究員邱麗娟介紹,大豆是重要的油料和高蛋白糧飼兼用作物。栽培大豆由其祖先種一年生野生大豆經(jīng)過人工選擇進(jìn)化而來,其中所蘊(yùn)藏的優(yōu)異基因的開發(fā)和利用對拓寬現(xiàn)代大豆品種的遺傳基礎(chǔ),改良品質(zhì),提高對病蟲害的抗性及對不良環(huán)境與氣候變化的適應(yīng)性具有重要意義。我國大豆資源總數(shù)居世界首位,其中一年生野生大豆占全世界野生大豆的90%。她表示,近年來,我國乃至世界大豆育種難以取得突破性進(jìn)展、單產(chǎn)停滯不前,主要原因是目前大豆品種的遺傳基礎(chǔ)狹窄,匱乏的基因源成為制約栽培大豆育種研究的關(guān)鍵。
項目組通過十余年大豆核心種質(zhì)構(gòu)建及遺傳多樣性研究發(fā)現(xiàn),大豆是高度自交作物,一個基因組無法準(zhǔn)確代表其物種基因的整體情況。為此,在系統(tǒng)研究基礎(chǔ)上,選擇7份有代表性的野生大豆進(jìn)行從頭測序和獨立組裝,構(gòu)建了野生大豆泛基因組。利用一套基于全基因組序列比對的結(jié)構(gòu)變異鑒定方法,項目組率先在全基因組水平上全面解析了野生和栽培大豆種間遺傳變異,特別是在闡明大豆種內(nèi)/種間結(jié)構(gòu)變異方面取得了突破,發(fā)現(xiàn)野生大豆特有、栽培大豆特有及馴化性狀建成相關(guān)的基因/遺傳變異千余個,其中野生大豆特有基因為首次報道。此外,發(fā)現(xiàn)野生大豆中與生物逆境抗性相關(guān)的R(抗?。┗蝾愋停赡苁瞧涞钟鶒毫由姝h(huán)境的內(nèi)在原因之一。
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