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桃全基因組重測序揭秘桃進(jìn)化歷史

  • 發(fā)布時間：2014-08-18 02:31:22  來源：農(nóng)民日報  作者：佚名  責(zé)任編輯：羅伯特

　　日前，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院鄭州果樹研究所王力榮研究團隊與深圳華大基因聯(lián)合開展的桃全基因組重測序工作取得階段性進(jìn)展。該研究對84份桃種質(zhì)進(jìn)行重測序，在全基因組水平上繪制了從光核桃到普通桃的進(jìn)化路線，并鑒定了與人工選擇相關(guān)的候選基因。相關(guān)研究結(jié)果在線發(fā)表于《基因組生物學(xué)》。

　　據(jù)項目主持人王力榮研究員介紹，普通桃起源于我國西藏的光核桃，然而在這兩個種之間的其他近緣種的進(jìn)化關(guān)系一直以來存在爭議。通過此次重測序，可以確定普通桃的進(jìn)化始于光核桃，之后為山桃，再次為甘肅桃，最終形成普通桃，而新疆桃只能認(rèn)為是普通桃的一個地理類群。

　　另外，與其他果樹相比，桃有個有趣的現(xiàn)象，即桃由于自交親和，一直被認(rèn)為是遺傳多樣性較低，然而桃上可以看到多種類型，如有毛的毛桃、無毛的油桃、扁平的蟠桃和油蟠桃，重瓣的花型、不同的花藥顏色等，這些性狀的多樣性在其他果樹如李、杏、櫻桃、蘋果和葡萄上是看不到的。研究發(fā)現(xiàn)，與野生的近緣種相比，雖然普通桃單核苷酸多態(tài)性（SNPs）只有野生桃的62%，然后在這些SNPs中，普通桃特有SNPs占到其總SNP的47.3%，該結(jié)果很好地解釋了桃多樣性的矛盾現(xiàn)象。

　　桃重測序也發(fā)現(xiàn)，由于桃自交親和及長期采用嫁接繁殖，在馴化過程中桃的雜合率急速衰減，普通桃高的純合率不僅為解析其表型性狀的分子機制提供便利，也為桃作為薔薇科果樹分子生物學(xué)研究的模式樹種提供了有力的證據(jù)。

　　本報記者吳佩通訊員吳斯洋

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