相同癌癥腫瘤基因變異各不相同
- 發(fā)布時間:2014-08-05 08:31:04 來源:科技日報 責任編輯:羅伯特
科技日報訊 就像沒有兩個人有相同的基因構(gòu)成,在乳腺癌病人中,也沒有兩個腫瘤的細胞有相同的基因組。據(jù)一項最新研究顯示,不同的乳腺癌亞型也有各種各樣變異的腫瘤。這一發(fā)現(xiàn)對乳腺癌的診斷和治療具有重要意義,有助于幫助那些發(fā)展出化療抗性的乳腺癌病人。相關(guān)論文發(fā)表在最近出版的《自然》雜志上。
該研究由美國德克薩斯大學(xué)遺傳學(xué)系副教授尼古拉斯·納溫研究小組負責。據(jù)物理學(xué)家組織網(wǎng)近日報道,他們開發(fā)出一種稱為“核測序”的新測序方法,可對單個細胞基因組測序,這種方法與單細胞分子測序相結(jié)合,能分析數(shù)千個細胞。
事實上,不同腫瘤細胞的生長速度也大大不同。“我們發(fā)現(xiàn)在腫瘤生長的不同階段,有兩種截然不同的‘分子鐘’在運作?!奔{溫說,“三陰性乳腺癌的腫瘤細胞具有增長的變異率,而雌激素受體陽性(ER+)乳腺癌腫瘤細胞就不是這樣?!?/p>
約75%的乳腺癌是ER+型,會隨著雌激素的增加而生長,對這些病人通常是用雌激素療法。三陰性乳腺癌在所有乳腺癌中約占15%到25%,通常對激素治療或標準化療沒有反應(yīng)。
“單細胞基因組學(xué)領(lǐng)域有一個常見問題,就是無法確認單個細胞中探測到的變異?!闭撐牡谝蛔髡摺⒒蚪M學(xué)系博士后研究員王勇(音譯)說,“為了處理這一問題,我們結(jié)合了單細胞測序和標靶單細胞深度測序。這樣不僅能確認變異,還能精確檢測數(shù)千個細胞的變異頻率?!?/p>
而化療中的重要問題是,腫瘤中某些細胞的變異是否為抵抗性變異,即治療導(dǎo)致的變異?!半m然這一問題在細菌中已經(jīng)研究了幾十年,但在大部分人類癌癥中還了解得很少?!奔{溫說,“我們的數(shù)據(jù)顯示,在化療之前,腫瘤細胞中就已經(jīng)存在大量多樣化的變異。因此我們期望,基因組多樣性檢測能起到預(yù)診的作用,識別出哪些病人可能發(fā)展出化療抗性?!?/p>
研究人員指出,對乳腺腫瘤的大群體測序研究已經(jīng)識別出許多主要的變異,但對變異的多樣性還知之甚少。本研究增加了人們對腫瘤內(nèi)“基因組多樣性”的理解。基因組多樣性在臨床中很有用,可用來預(yù)測腫瘤侵襲、轉(zhuǎn)移和病人生存率。(常麗君)
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