基因測序“叫?!薄爸貑ⅰ睘槟陌??
- 發(fā)布時間:2014-08-02 04:06:45 來源:經(jīng)濟日報 責(zé)任編輯:羅伯特
圖①:“實驗員正利用基因測序儀器MiSeq進(jìn)行微生物樣本測序。
圖②:諾禾致源生物信息科技有限公司從國外引進(jìn)的高通量基因測序儀器HiSeq Xten,將進(jìn)一步加速癌癥和遺傳疾病研究。
圖③:未來,基因測序有望成為常規(guī)檢測。
本報記者 沈慧攝
近日基因測序再度出現(xiàn)變數(shù)。6月30日,國家食品藥品監(jiān)督總局批準(zhǔn)了華大基因的兩款基因測序儀和兩款檢測試劑盒注冊。這也是繼今年2月國家衛(wèi)計委、國家食藥監(jiān)局聯(lián)合叫停所有基因測序臨床應(yīng)用后,官方首次正式批準(zhǔn)注冊二代基因測序診斷產(chǎn)品,意味著基因測序臨床應(yīng)用重新啟動。
據(jù)悉,這次獲批的產(chǎn)品可通過對孕周12周以上的高危孕婦外周血血漿中的游離DNA片段進(jìn)行基因測序,篩查出新生兒是否存在唐氏綜合征等先天性基因缺陷風(fēng)險。曾經(jīng)遭受冷遇的基因測序為何能夠“解禁”?到底何為基因測序?它又將帶來怎樣的影響?圍繞這些疑問,記者采訪了相關(guān)領(lǐng)域的專家。
叫停原因:規(guī)范市場
對于基因測序的“叫停—重啟”,華中科技大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院教授郭安源認(rèn)為,這是國家規(guī)范市場的行為。
謹(jǐn)慎源于風(fēng)險。衛(wèi)計委、國家食藥監(jiān)局此前發(fā)布聯(lián)合通知指出,基因測序相關(guān)產(chǎn)品和技術(shù)“涉及倫理、隱私和人類遺傳資源保護(hù)、生物安全以及醫(yī)療機構(gòu)開展基因診斷服務(wù)技術(shù)管理、價格、質(zhì)量監(jiān)管等一系列問題”。
事實的確如此。以基因測序涉及的倫理隱私問題為例,“假若檢測基因時發(fā)現(xiàn),兩個陌生人原來竟是同父異母(同母異父)的關(guān)系,是否該告知?假如新生兒測出帶有致病基因,家長如何處理?所以不能隨便什么機構(gòu)都可以開展”,中國科學(xué)院北京基因組研究所副所長于軍坦陳。
不僅如此,混亂的基因檢測市場也著實讓人擔(dān)憂。于軍告訴記者,在叫停前,國內(nèi)一些體檢機構(gòu)所謂的“全基因檢測”,往往要價高至七八萬甚至幾十萬,但實質(zhì)卻是基因芯片技術(shù)。“基因芯片雖然可以檢測大量基因,但假陽性率高,準(zhǔn)確性不足”,于軍表示。
這一說法也得到諾禾致源生物信息科技有限公司副總經(jīng)理李宗文的認(rèn)可?!盎驕y序市場魚龍混雜,不少體檢機構(gòu)推出的名目繁多的‘基因體檢’往往缺乏充分的安全性、有效性和倫理性驗證?!崩钭谖恼f,其使用的測序儀及相關(guān)診斷試劑和軟件,很多并未經(jīng)過醫(yī)療器械的注冊審批。而按照規(guī)定,目前國內(nèi)使用的基因檢測儀器、診斷試劑等產(chǎn)品,需經(jīng)食品藥品監(jiān)管部門審批注冊,并經(jīng)衛(wèi)生計生行政部門批準(zhǔn)技術(shù)準(zhǔn)入方可應(yīng)用。
“叫停是為規(guī)范‘搶跑者’的不合規(guī)行為,并規(guī)范使用基因測序方法對遺傳性疾病進(jìn)行研究。如今,華大基因已通過國家食藥總局相關(guān)醫(yī)療器械及產(chǎn)品注冊的審查,這也意味著國內(nèi)整個行業(yè)的放開?!崩钭谖膹娬{(diào)。
在李宗文看來,這種先叫停再重啟的現(xiàn)象在醫(yī)療領(lǐng)域較為普遍,與10年前PCR(聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))技術(shù)應(yīng)用于醫(yī)療檢測時所面臨的處境極其相似。當(dāng)時PCR技術(shù)在國外應(yīng)用非常成熟,國內(nèi)很多公司已經(jīng)開始做該技術(shù)的臨床應(yīng)用,但國內(nèi)沒有任何相關(guān)條例和規(guī)范。國家因此叫停PCR技術(shù)的臨床應(yīng)用,經(jīng)過叫停、重啟、行業(yè)試點、納入規(guī)范等環(huán)節(jié)后開放第一批注冊,再開放第二批注冊,以此形成一個較為規(guī)范的市場格局。
“基因測序是一個有巨大潛力的新技術(shù),但由于國家層面缺乏相應(yīng)的法規(guī)和政策,其發(fā)展存在一些亟須解決的問題。經(jīng)歷叫停之后的5個月,國家對市場進(jìn)行規(guī)范再重啟,這是意料之中的行為”。郭安源表示。
臨床應(yīng)用: 五大領(lǐng)域
不可否認(rèn),目前基因測序的臨床應(yīng)用仍存在諸多問題。但在軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院生物工程研究所所長陳薇看來,其發(fā)展前景依舊十分樂觀,“等監(jiān)管手段和監(jiān)控體系跟上去后,基因測序會進(jìn)一步開放,不會因噎廢食”。
看好基因測序這一市場的不只是陳薇。就在我國將基因測序“封凍”兩個月后,世界最大的基因測序儀器制造商Illumina的高層就來到中國,并高調(diào)表示“十分看好中國基因測序市場”。
信心源自基因測序技術(shù)的廣泛應(yīng)用?;驕y序,又稱DNA測序,是一種破解基因密碼(堿基序列)的技術(shù)。按照郭安源的解釋,即“了解一個人遺傳背景的技術(shù),分析個體遺傳自上輩人、又將傳遞給下輩人的基因信息與他人有何不同”。
“基因上的差異構(gòu)成了人體生理情況的差異,基因測序通過解碼生命這本天書,有助于人類生老病死規(guī)律的揭秘和人類患病基因的掌握,對人類疾病的預(yù)防和診斷起到輔助性的作用。”郭安源表示。
記者了解到,相比此前盲目“叫價”的亂象,今后基因測序價格或?qū)⒕S持在3500元上下。同時,隨著基因測序技術(shù)的飛速發(fā)展以及測序成本的大幅降低,新一代基因測序技術(shù)將不再神秘,其臨床應(yīng)用領(lǐng)域?qū)⒅鸩酵卣沟缴】?、腫瘤個體化診斷和治療、遺傳病、傳染病、移植分型等五大領(lǐng)域。
比如,通過基因測序可確認(rèn)腫瘤患者患病的基因,或受檢者是否攜帶腫瘤易感基因。“這是個性化診療的第一步。”李宗文介紹,若被查出患上某種疾病的風(fēng)險較大,可進(jìn)行預(yù)防或提前干預(yù);還可為治療癌癥提供更精準(zhǔn)的方案,以前癌癥通常是“千人一療法,萬人一種藥”,其實每個人基因各異,對藥物的敏感程度和耐受程度不同,通過基因檢測,可以告訴醫(yī)生某種藥物可以用,但劑量要較常規(guī)減半或增加。
再比如,目前我國基因測序技術(shù)應(yīng)用最成熟的無創(chuàng)產(chǎn)前篩查,通過對孕婦外周血血漿進(jìn)行檢測,可判斷胎兒患唐氏綜合征的風(fēng)險,與傳統(tǒng)的羊水穿刺產(chǎn)檢法相比,診斷準(zhǔn)確度高、流產(chǎn)風(fēng)險低。
但生育健康是目前基因測序應(yīng)用較為廣泛的領(lǐng)域。研究表明,健康人群中平均每人攜帶隱性基因突變2.8個,遺傳病占嬰兒死亡原因的20%左右?!半[性遺傳病攜帶者基因篩查是預(yù)防缺陷寶寶出生的關(guān)鍵,該篩查不僅市場廣闊,且社會效益巨大?!崩钭谖耐嘎?,除了篩查隱性遺傳攜帶者,人類全基因組測序技術(shù)已成為發(fā)現(xiàn)致病基因、探究疾病發(fā)生發(fā)展機制的重要工具。
未來目標(biāo): 常規(guī)檢測
盡管基因測序前景可期,但怎樣抓住這一難得的機遇推動其持續(xù)快速健康發(fā)展,還面臨重重困難。
如何保證基因測序涉及的隱私便是障礙之一。郭安源表示,基因測序涉及很多個人隱私,如果有關(guān)個人基因缺陷的信息被保險公司或者雇主掌握,可能會對個人產(chǎn)生不利影響。在李宗文看來,技術(shù)更新周期短、風(fēng)險高和高成本瓶頸也一定程度上制約著基因測序產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。“3個月甚至更短的技術(shù)更新周期,讓企業(yè)要花較高的費用購買儀器,這阻礙了技術(shù)的快速普及?!?/p>
陳薇則擔(dān)心,基因檢測可能會降低被檢測者的生活幸福度。她說,基因測序可以判斷出被檢測者患上某種疾病的可能性,但這種疾病易感性只是一個概率,并不意味絕對會患某種疾病?!叭绻粋€嬰兒被檢測出有患上糖尿病的高風(fēng)險,他的一生可能在飲食或其他生活習(xí)慣上都要受到限制,可能會對其成長甚至心理都造成不良影響,影響其生活質(zhì)量?!标愞北硎?。
此外,技術(shù)也是基因測序發(fā)展之路上的屏障。眾所周知,人類基因組有30億個堿基對,用基因測序儀器得到的數(shù)據(jù)是4種堿基的排列,數(shù)據(jù)異常龐大?!皞€體全基因組測序會產(chǎn)生100G數(shù)據(jù),從中解析出的有臨床意義的數(shù)據(jù),光靠人力解讀是不現(xiàn)實的?!惫苍凑J(rèn)為,如何發(fā)展高通量的數(shù)據(jù)分析軟件、解決生物信息行業(yè)的人才稀缺問題,是應(yīng)對基因測序海量數(shù)據(jù)的關(guān)鍵所在。
對此,于軍亦有同感。他告訴記者基因測序所生成的原始數(shù)據(jù)必須通過專業(yè)人員進(jìn)行分析和解讀,利用計算機科學(xué)和信息技術(shù)揭示大量而復(fù)雜的生物數(shù)據(jù)所特有的規(guī)律,對于整個基因測序行業(yè)尤為重要。然而,現(xiàn)今的生物信息分析涉及的數(shù)據(jù)存儲、解讀及共享是整個基因測序行業(yè)面臨的最大難題。
不過可以肯定的是,基因測序正引發(fā)新一輪投資熱潮。近日專業(yè)信息提供商湯森路透在其《2025年世界十大創(chuàng)新預(yù)測》報告中指出,屆時“嬰兒出生時進(jìn)行DNA檢測將成為常規(guī)檢測”。
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